В конце XIII века на берегу Москвы-реки, к югу от Кремля, святой благоверный князь Даниил (1261–1303) воздвиг церковь в честь св. Даниила Столпника, своего небесного покровителя. Именно этот небольшой деревянный храм является началом славного Данилова монастыря — первого в Московской земле.

Князь Даниил был сыном прославленного в русской истории святого князя Александра Невского. Именно князь Даниил заложил основание будущего величия Москвы, положил начало мощному единому русскому государству. Он стал родоначальником династии Великих князей Московских, а затем и Царей Российских.

Незадолго до кончины князь Даниил принял монашеский постриг в основанной им обители и был погребен, по его завещанию, на общем монастырском кладбище.

В 1330 году сын Даниила Иоанн Калита перевел братию Данилова монастыря в Кремль, а на месте монастыря более двух веков стоял лишь приходской храм. Но на скромной могиле князя совершались чудеса, росло почитание князя Даниила, и при царе Иоанне Грозном Данилов монастырь был возобновлен на прежнем месте, а в 1652 году были обретены нетленные мощи святого князя.

В XIX веке Даниловский некрополь был известен как место погребения славянофилов. Там были могилы А. С. Хомякова, Ю. Ф. Самарина, В. А. Черкасского и многих других. Особенно было знаменито кладбище могилой Н. В. Гоголя.

XX столетие явило миру тысячи новых мучеников и исповедников российских. Среди них имена братии Данилова монастыря. В те тяжелые годы именно Данилов монастырь, руководимый архиепископом Феодором (Поздеевским), остался незыблемой твердыней Православия. Монастырь продержался больше всех других московских обителей и был закрыт в 1930 году. После закрытия монастыря в нем долгие десятилетия находился детский приемник-распределитель для малолетних преступников.

В 1983 году монастырь был возвращен верующим для создания на его территории Духовно-административного центра Русской Православной Церкви. К юбилею 1000-летия Крещения Руси праздновавшемуся в 1988 году, монастырь был восстановлен и стал центром юбилейных торжеств.

Можно сказать, что открытие Данилова монастыря стало началом новой эпохи в истории Русской Православной Церкви — эпохи возрождения Православия на Руси.